Biochemistry

Matakuliah ini membahas metode teknologi asam nukleat dan protein serta aplikasinya pada berbagai bidang (pertanian, kesehatan, industry, dsb) yang meliputi:  random (gen pustaka genom dan cDNA, terutama menyangkut fragmen ujung tumpul produk PCR/cDNA) dan spesifik gen cloning;  analisis berbasis pemetaan DNA (DNA finger printing, filogenetik, keragaman genetik pada tanaman, foot printing, dsb);  bloting (Southern, Nothern, Western, dot blot, koloni blot);  labeling (warna, radioaktif, fluorosensi);  hibridisasi;  analisis afinitas (probing/hibridisasi, ELISA, RIA, histokimia, imunokimia, kromatografi afinitas, dsb);  sintesis dan sequenching asam nukleat/protein;  site-directed mutagenesis;  serta berbagai contoh aplikasi analisis (mikroba berbahaya pada makanan/penyakit;  kehalalan;  keragaman bibit;  penentuan bibit yang baik untuk tanaman yang usia tumbuhnya lama, DNAnanoteknologi, DNAchip, gen trapi, dsb).

Praktikum melatih keterampilan mahasiswa dalam mengikuiti prosedur percobaan, mempersiapkan bahan  dan alat, melakukan percobaan, menganalisis dan melaporkan hasil percobaan yang terkait dengan rekayasa asam nukleat dan protein, termasuk di dalamnya teknik isolasi dan pemurnian DNA kromosom dan plasmid, restriksi DNA, rekombinasi dan kloning. Selain itu juga praktikum ini memberikan keterampilan bagi mahasiswa dalam melakukan elektroforesis.


Mata kuliah ini membahas gugus fungsional dalam biomolekul dan macam reaksi yang mendasari proses biokimia; air sebagai media kehidupan sel; energi kehidupan sel; struktur dan fungsi senyawa hayati penyusun sel makhluk hidup (protein, karbohidrat, lipid, dan asam nukleat) serta metabolismenya (anabolisme dan katabolisme) termasuk fotosintesis, informasi genetik, dan sintesis protein.


Mata kuliah ini menjelaskan teori-teori umumyang mendasari Biokimia meliputi: proses seluler, kimia dan fisika; kimia inti;dan juga terampil dalam air, asam, basa dan buffer; sistem koloid; aspek kimiaorganic; kesetimbangan kimia dan katalisis; dan kelarutan. Serta mampumerencanakan dan melaksanakan pekerjaan laboratorium
This course will discuss the ultrastructure of the prokaryote and eukaryote cells in low and high-level like yeasts, plants and animals; function and role of the cell membrane in the life of an organism, function and role organelles cell such as nucleus, endoplasmic reticulum, golgi apparatus, mitochondria and chloroplasts, lysosomes and peroxisomes, cytoskeleton, and ektracellular matrix.
Mata kuliah ini menjelaskan danmenggambarkanstruktur dan fungsi biomolekul karbohidrat,lipid, asam amino danprotein, asam nukleat, vitamin dan mineral, serta hal lain terkait fungsidalambiokimia. Selain itu peserta didik memiliki keterampilan laboratoriumdalam melakukan identifikasidan analisis secara kualitatif dan kuantitatifmolekul karbohidrat, lipid, asam amino dan protein,vitamin dan mineral
Mata kuliah ini menjelaskan teori-teori umumyang mendasari Biokimia Seluler, yaitu meliputi ultrastruktur dan organisasisel; teknik dalam mempelajari struktur dan fungsi, struktur dan organisasimembran plasma; struktur dan organisasi inti sel, retikulum endoplasma,aparatus golgi, lisosom, vakuola, peroksisom, mitokondria, kloroplas, rangkasel, pertautan sel, pelekatan sel, matrks ekstra sel; mekanisme selulerapoptosis dan kanker
Mata kuliah ini menjelaskan konsep dan prinsipdasar biokimia fisik meliputi: keterkaitan konsep teoritis terhadap biosains;asal mula berbagai rumus/persamaan dalam biokimia fisik; link di antara teoridan eksperimen; dan mampu menerapkan perhitungan sederhana tetapndenganrealistik
Mata kuliah ini menjelaskan replikasi dantranskripsi di system eukariot dan prokariot, prinsip operon, sintesis protein,modifikasi pasca translasi, purifikasi protein dan sintesis makromolekul.Mempelajari protein meliputi evolusi struktur dan aktivitas biokimia, proteinplasma dan blood clotting, membrane biologi dan membrane transport, regulasienzim dan mekanismenya, penyakit metabolit dan asesmen biokimianya
Mata kuliah ini mempelajari teknik dasar danumum dalam Laboratorium Biokimia termasuk juga kimia serta biologi;mempersiapkan catatan laboratorium dan melakukan pengamatan laboratorium yangakurat serta tercatat dalam catatan kerja laboratorium; analisis danintepretasi data hasil pekerjaan laboratorium dengan benar; melaporkan hasilpekerjaan laboratorium dalam bentuk tertulis dengan benar; memahami keselamatanlaboratorium umum, keamanan dan praktek keselamatan Biokimia
Mata kuliah ini mempelajari prinsip dan konsepbiokimia dalam proses fotosintesis tumbuhan dan hubungannya dengan manusia danlingkungannya, prinsip biokimia dalam proses pertumbuhan dan perkembangantumbuhan, pentingnya hormone tumbuhan dan metabolit sekunder untuk pertumbuhandan perkembangan tumbuhan dan juga fungsinya dalam nutrisi dan kesehatanmanusia, potensi aplikasi beberapa tanaman dalam medis termasuk keamanannyadalam meningkatkan layanan kesehatan, menjelaskan konsep dan prinsip dasar biokimiadengan pengatur pertumbuhan dan herbisida
Mata kuliah ini menjelaskan, mengidentifikasidan menganalisis peranan, metabolisme dan regulasi molekul terhadap tipemorfologi, nutrisi, mekanisme fisiologi dan biologi molekuler padamikroorganisme, serta aplikasinya
Mata kuliah ini menjelaskandalam membuat tulisanilmiah dan teknik penyajian lisan
Mata kuliah ini menjelaskan konsep dan prinsipdasar dalam sistem transformasi energi selular dan pemanfaatannya olehorganisme pada proses kehidupan dengan mengkaji hukum termodinamika I dan II,senyawa kimia berenergi tinggi, bioenergi metabolisme, aliran bioenergi dialam, fotosintesis, respirasi, kontraksi otot dan gerak, translokasi melaluimembran sel, ATP seluler, ikatan fosfat dan energi bebas yang dihasilkan ATP,biosintesis ATP seluler
Mata kuliah ini menjelaskan konsep dan prinsipumum bioenergetika dalam metabolisme dan proses lintasan proses metabolism darikarbohidrat, lipid, protein dan nukleotida
Mata kuliah ini membahas konsep-konsep dalamberbagai lintasan metabolisme dan regulasinya untuk menyelesaikanmasalah/fenomena yang timbul dalam peristiwa kehidupan aktual/sehari-hari ditengah masyarakat, berkomunikasi secara efektif dan bekerja sama dalam timmultidisiplin, berpikir kritis, kreatif, dan inovatif, serta memiliki kemampuanintelektual untuk memecahkan masalah pada tingkat individual dan kelompok
Mata kuliah ini menjelaskan tentang enzim,mekanisme, kinetika, termodinamika, dan aplikasi enzim, serta cara isolasi danpemurnian enzim. Mahasiswa dapat merancang percobaan laboratorium yang efektifdan aman serta menyusun rencana kerja kelompok secara efektif untuk melakukanisolasi, pemurnian dan karakterisasi enzim (pengaruh pH, suhu, substrat), sertakinetika enzim (Km dan Vmaks). Mahasiswa dapat menginterpretasi data daninformasi yang diperoleh
Mata kuliah ini menjelaskan berbagai teknikpersiapan sampel untuk analisis biokimiadan biomolekuler, prinsip sentrifugasi dan fraksinasi subseluler dan menganalisis data hasilsentrifugasi dan fraksinasi subseluler,prinsip dan dasar teknik Luminesensi, kemoluminesensi, luciferasi, fluoresensiprotein, prinsip dan konsep tekniksekuensing DNA dan menganalisis data daninformasi dari hasil sekuensing DNA, prinsip dan konsep dasar teknikelektroforesis dan menganalisis data daninformasi hasil elektroforesis, prinsipdasar teknik kromatografi dan penerapannya dalam bioanalisis senyawamakromolekul

Mata kuliah inimempelajari prinsip-prinsip dasar instrumentasi dan teknik-teknik yangdigunakan dalam bidang biokimia dan biomolekuler

Mata kuliah ini mempelajari penerapankonsep-konsep dalam proses respon imun tubuh dan pemanfaatan teknik imunokimiauntuk menyelesaikan masalah/fenomena yang timbul dalam riset biokimia,berkomunikasi secara efektif dan bekerja sama dalam tim multidisiplin, berpikirkritis, kreatif, dan inovatif, serta memiliki kemampuan intelektual untukmemecahkan masalah pada tingkat individual dan kelompok
Mata kuliah ini Menjelaskan mekanisme biokimiadan genetic proses biosignal antara tanaman dan mikroba tanah;Mendemonstrasikan peran pupuk hayati dan biopestisida sebagai alat pentingdalam mencapai ketahanan pangan pada masa depan untuk pertanian berkelanjutan;Mendemonstrasikan keterampilan teknik yang ramah lingkungan untuk mengendalikanpencemaran dan pengelolaan limbah
Mata kuliah ini menjelaskan, mengidentifikasidan menganalisis peranan komponen-komponen zat nutrisi, meliputi fungsimetabolisme, fisiologis, biokimia serta implikasinya terhadap timbulnyapenyakit dan mampu menjelaskan kecukupan asupan zat nutrisi makanan dalamsiklus kehidupan manusia
Mata kuliah ini menjelaskan tentangfaktor-faktor utama dalam bioteknologi industry (bioindustri), langkah-langkahstrategi dalam mendesain atau mengatasi permasalahan yang berkaitan denganpengembangan substrat (karbon dan nitrogen); pengembangan proses (fermentasi);pengembangan isolasi produk; pengembangan galur mikroba pada bioindustri, danaplikasi teknologi DNA rekombinan dalam pemulian galur mikroba yang digunakandalam bioindustri

Mata kuliah ini membahaspenerapan konsep-konsep dalam Biokimia Medis untuk menyelesaikanmasalah/fenomena yang timbul di tengah masyarakat, berkomunikasi secara efektifdan bekerja sama dalam tim multidisiplin, berpikir kritis, kreatif, daninovatif, serta memiliki kemampuan intelektual untuk memecahkan masalah padatingkat individual dan kelompok

Mata kuliah inimempelajari klasifikasi senyawa toksik di lingkungan dan contoh-contohspesifik; rute paparan toksikan; menjelaskan proses absorbs, metabolisme daneliminasi senyawa toksik; menjelaskan faktor lingkungan dan fisiologi yangmempengaruhi metabolisme senyawa toksik

Mata kuliah ini mengumpulkan, merekam danmenganalisa data ilmiah dengan menggunakan metodologi yang tepat; Melakukanmini-proyek penelitian mandiri sesuai minat dengan berinteraksi secara aktifdalam sebuah laboratorium penelitian; Melakukan pencarian literature secarakomprehensif dalam mendukung konsep umum dan latar belakang yang spesifik untukmenjelaskan pentingnya proyek penelitian dilakukan; Merumuskan pertanyaan atauhipotesis yang akan diuji dalam proyek penelitian; Mengkomunikasikan hasilproyek penelitian dengan jelas, ringkas dan dalam forum ilmiah sederhana;Membahas, menafsirkan dan mengevaluasi penelitian sendiri secara ringkas danbenar dalam sebuah laporan ilmiah dengan gaya yang sesuai dengan bidang studi
Kegiatan ini dilakukan di lembaga penelitian,perguruan tinggi, atau perusahaan swasta dalam rangka pengembangan kemampuanmahasiswa serta bertujuan memperluas wawasan mahasiswa mengenai profesiilmunya. Mahasiswa dapat mengambil mata kuliah ini setelah jumlah kredit sksnya sebesar 110 sks
Mahasiswa diwajibkan membuat proposal penelitianuntuk tugas akhirnya dan dipresentasikan di hadapan dosen pembimbing sertasemua mahasiswa yang sudah siap melakukan penelitian. Mahasiswa dapat mengambilmata kuliah ini setelah jumlah kredit sksnya sebesar 110 sks
Mahasiswa diwajibkan mengikuti seminar mahasiswasebanyak minimum 8 kali dan seminar dosen yang diselenggarakan oleh DepartemenBiokimia sebanyak minimum 2 kali. Sebagai bekal bagi mahasiswa dalammempresentasikan hasil penelitiannya dalam seminarnya sendiri. Mahasiswadiwajibkan menjelaskan hasil penelitian yang dilakukan, mendapat umpan balikdari diskusi dalam memperbaiki karya ilmiah
Mahasiswa melakukan penelitian dan menulis hasilpenelitian di bawah bimbingan suatu komisi pembimbing, yang maksimum terdiriatas 3 (tiga) orang dosen pembimbing yang ditunjuk oleh Ketua DepartemenBiokimia. Mahasiswa tersebut menyajikan dan mempertahankan makalah hasilpenelitiannya di hadapan sidang komisi

Mata kuliah iniMenjelaskan konsep dan prinsip umum biosinyal termasuk tipe sinyal, ligan,reseptor, dan lain-lain. Menjelaskan macam-macam biosinyal (chemicals,light, pressure, temperature, etc.) yang mempengaruhi proses dan atautingkah laku organisme hidup Mengidentifikasi persamaan dan perbedaan berbagaimacam proses biosinyal dalam system biologi, Mengidentifikasi tipe/jenisbiosinyal yang menghasilkan respon dalam sistem biologis

Mata kuliah ini mempelajari penerapan dasar-dasarkimia fisiologi terutama yang menyangkutcairan tubuh dan fungsi organ-organtubuh terpenting dan kaitannya dengan diagnosis gangguan kesehatan tubuh padaumumnya. Serta pemanfaatan teknik diagnostik klinis untuk menyelesaikanmasalah/fenomena yang timbul dalam riset biokimia maupun kehidupan nyata,berkomunikasi secara efektif dan bekerja sama dalam tim multidisiplin, berpikirkritis, kreatif, dan inovatif, serta memiliki kemampuan intelektual untukmemecahkan masalah pada tingkat individual dan kelompok
Mata kuliah ini menjelaskan prinsip dasar danmenerapkan teknik dan tools Bioinformatika dalam analisis genom,protein, evolusi genetik, penentuan struktur maupun fungsi asam nukleat danprotein dan mampu memprediksi sifat atau karakteristik dari asam nukleat danprotein berdasarkan database yang ada