Mata kuliah Fisiologi Mikrob menyajikan pembahasan mengenai proses-proses fisiologi yang mencakup reproduksi dan pertumbuhan, metabolisme, diferensiasi sel, dan respon terhadap lingkungan ekstrem serta metabolit sekunder. Dalam membahas metabolisme akan didiskusikan mengenai regulasi dan kinetika enzim, sintesis dan degradasi asam amino, lipid. Pembahasan reaksi mikroba terhadap lingkungan ekstrem meliputi kemotaksis, quorum sensing, pembentukan biofilm, degradasi xenobiotik, kondisi pH, suhu dan lingkungan ekstrem lainnya